More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2014 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  56.64 
 
 		 544 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  57.87 
 
 		 546 aa  693    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 542 aa  1134    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  58.05 
 
 		 546 aa  693    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  57.41 
 
 		 549 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  57.3 
 
 		 546 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  55.47 
 
 		 546 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  58.77 
 
 		 551 aa  693    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  59.33 
 
 		 552 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  55.78 
 
 		 530 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  55.33 
 
 		 538 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  54.75 
 
 		 550 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  55.51 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  54.91 
 
 		 538 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  53.64 
 
 		 541 aa  611  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  52.05 
 
 		 1043 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  53.01 
 
 		 560 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  55.33 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  51.08 
 
 		 562 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  51.25 
 
 		 576 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  52.8 
 
 		 545 aa  600  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  53.42 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  51.71 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  52.17 
 
 		 560 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  51.25 
 
 		 564 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  51.72 
 
 		 560 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  51.27 
 
 		 562 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  52.07 
 
 		 565 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  51.63 
 
 		 557 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  50.72 
 
 		 571 aa  591  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  52.63 
 
 		 560 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  53.31 
 
 		 547 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  51.4 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  51.54 
 
 		 560 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  50.54 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  50.27 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  51.08 
 
 		 561 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  50.72 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  51.44 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  50.27 
 
 		 566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  50.18 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  51.62 
 
 		 558 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  49.46 
 
 		 576 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  51.71 
 
 		 562 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  49.2 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  49.36 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  49.56 
 
 		 578 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  49.56 
 
 		 578 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  48.4 
 
 		 605 aa  571  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  50.91 
 
 		 550 aa  568  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  50.71 
 
 		 577 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  51.25 
 
 		 579 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  50 
 
 		 601 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  48.83 
 
 		 575 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  50.18 
 
 		 602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  49.64 
 
 		 584 aa  561  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  49.54 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  50.18 
 
 		 596 aa  558  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  49.55 
 
 		 576 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  48.29 
 
 		 575 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  48.85 
 
 		 577 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  49.37 
 
 		 576 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  49.37 
 
 		 576 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  48.11 
 
 		 575 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  48.29 
 
 		 575 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  48.83 
 
 		 575 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  49.19 
 
 		 576 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  49.37 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  49.37 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  49.37 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  48.9 
 
 		 543 aa  548  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  49.38 
 
 		 576 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  48.65 
 
 		 575 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  49.37 
 
 		 570 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  48.65 
 
 		 575 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  48.12 
 
 		 576 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  50.09 
 
 		 572 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  48.21 
 
 		 552 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  49.73 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  49.36 
 
 		 570 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 		 574 aa  542  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  49.07 
 
 		 552 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  50.57 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  49.18 
 
 		 578 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  50.74 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  48.61 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  47.33 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  48.43 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  47.56 
 
 		 571 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  49.01 
 
 		 570 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  49.36 
 
 		 570 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.17 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  47.58 
 
 		 576 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  47.57 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  47.23 
 
 		 578 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  48.46 
 
 		 570 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  48.46 
 
 		 570 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>