More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2941 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  56.36 
 
 		 571 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  55.72 
 
 		 576 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 570 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  89.71 
 
 		 562 aa  1046    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  74.37 
 
 		 560 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  89.35 
 
 		 557 aa  1042    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  57.51 
 
 		 571 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  74.37 
 
 		 560 aa  886    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  57.99 
 
 		 562 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  54.48 
 
 		 596 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  55.86 
 
 		 546 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  56.73 
 
 		 571 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 576 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  57.82 
 
 		 578 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  55.8 
 
 		 565 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 576 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  74.82 
 
 		 565 aa  886    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  56.04 
 
 		 546 aa  641    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  73.47 
 
 		 560 aa  858    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  56.26 
 
 		 575 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  59.75 
 
 		 562 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 557 aa  1157    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  57.43 
 
 		 576 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  57.61 
 
 		 576 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  75.63 
 
 		 561 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  58.18 
 
 		 601 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  58.56 
 
 		 577 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  55.98 
 
 		 576 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  74.55 
 
 		 560 aa  885    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  55.17 
 
 		 576 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  55.48 
 
 		 560 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  57.27 
 
 		 564 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  56.7 
 
 		 564 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  56.81 
 
 		 570 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 576 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  55.72 
 
 		 575 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  55.35 
 
 		 575 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  56.79 
 
 		 578 aa  651    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  56.08 
 
 		 575 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  54.11 
 
 		 566 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  55.35 
 
 		 575 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  76.35 
 
 		 564 aa  892    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  55.72 
 
 		 575 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  54.68 
 
 		 564 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  59.27 
 
 		 576 aa  693    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  57.84 
 
 		 572 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 576 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 576 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  56.08 
 
 		 575 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  89.71 
 
 		 557 aa  1047    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  58.7 
 
 		 544 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  57.62 
 
 		 577 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  56.79 
 
 		 578 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  57.25 
 
 		 576 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  57.25 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  53.07 
 
 		 574 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  53.72 
 
 		 571 aa  634  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  56.65 
 
 		 579 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  56.75 
 
 		 596 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  53.15 
 
 		 566 aa  625  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  54.59 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  56.7 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  54.83 
 
 		 602 aa  622  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  56.7 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  55.43 
 
 		 539 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  56.7 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  54.41 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  52.16 
 
 		 568 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  53.68 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  54.89 
 
 		 538 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  55.86 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  53.41 
 
 		 578 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  56.4 
 
 		 550 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  51.81 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  52.4 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  52.4 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  52.77 
 
 		 570 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  52.58 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  52.77 
 
 		 574 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  52.4 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  53.55 
 
 		 584 aa  609  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  54.1 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  52.4 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  53.7 
 
 		 579 aa  609  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  54.89 
 
 		 1043 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  54.71 
 
 		 538 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  52.43 
 
 		 566 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  49.54 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  54.55 
 
 		 539 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  57.66 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 		 541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  55.42 
 
 		 550 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 		 566 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  53.19 
 
 		 558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  55.05 
 
 		 530 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  53.94 
 
 		 558 aa  601  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  55.32 
 
 		 549 aa  601  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  52.1 
 
 		 560 aa  594  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  50.9 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  53.09 
 
 		 576 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.725771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>