More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0403 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  57.63 
 
 
549 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  61.99 
 
 
552 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  100 
 
 
550 aa  1146    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  61.65 
 
 
550 aa  710    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  57.86 
 
 
563 aa  659    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  70.73 
 
 
550 aa  830    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  74.5 
 
 
549 aa  900    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  57.3 
 
 
605 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  60.73 
 
 
552 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  59.77 
 
 
560 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  60.44 
 
 
549 aa  690    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  58.05 
 
 
552 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  70.02 
 
 
549 aa  816    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  59.18 
 
 
549 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  62.27 
 
 
547 aa  728    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  70.91 
 
 
550 aa  831    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  67.16 
 
 
561 aa  784    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  60.56 
 
 
544 aa  697    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  56.9 
 
 
554 aa  671    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  59.74 
 
 
552 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  55.08 
 
 
553 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  59.18 
 
 
549 aa  678    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  60.44 
 
 
549 aa  692    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  61.09 
 
 
549 aa  690    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  73.91 
 
 
548 aa  875    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  71.17 
 
 
548 aa  844    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  61 
 
 
568 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  51.22 
 
 
566 aa  588  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  53.18 
 
 
566 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  51.02 
 
 
571 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  51.4 
 
 
566 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  48.53 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
564 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 
564 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  52.56 
 
 
605 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 
843 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  47.58 
 
 
565 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 
576 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  49.82 
 
 
546 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  49.63 
 
 
546 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 
576 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
579 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  50.09 
 
 
546 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  50.09 
 
 
601 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  50.74 
 
 
577 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  50.37 
 
 
576 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  48.88 
 
 
575 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  48.43 
 
 
562 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  49.44 
 
 
576 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 
562 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  48.7 
 
 
560 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 
576 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
596 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  50.74 
 
 
577 aa  548  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  48.88 
 
 
575 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  48.24 
 
 
557 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  47.96 
 
 
564 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  50.56 
 
 
552 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 
562 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  49.63 
 
 
576 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  48.11 
 
 
564 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  48.69 
 
 
575 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
576 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
576 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
570 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
576 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
576 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  48.88 
 
 
575 aa  545  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  48.14 
 
 
557 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  47.31 
 
 
560 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  48.8 
 
 
570 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  48.51 
 
 
575 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  48.88 
 
 
575 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  48.51 
 
 
575 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
576 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 
576 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  48.22 
 
 
571 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  47.58 
 
 
560 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 
558 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
551 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  47.71 
 
 
538 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  47.5 
 
 
560 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  47.56 
 
 
565 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  47.32 
 
 
560 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  48.53 
 
 
549 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  47.95 
 
 
1043 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  48.41 
 
 
540 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  47.34 
 
 
570 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  47.61 
 
 
570 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  47.89 
 
 
568 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  47.32 
 
 
570 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  47.15 
 
 
574 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  48.41 
 
 
540 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
544 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  46.73 
 
 
571 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  50.09 
 
 
572 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  46.54 
 
 
571 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  48.15 
 
 
561 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  48.26 
 
 
578 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  46.86 
 
 
570 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>