More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0447 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
927 aa  1801    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  48.23 
 
 
915 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.98 
 
 
978 aa  695    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  56.64 
 
 
922 aa  827    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  50.59 
 
 
861 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  49.89 
 
 
899 aa  757    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  47.91 
 
 
875 aa  688    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.54 
 
 
922 aa  565  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  36.21 
 
 
544 aa  243  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  36.01 
 
 
545 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 
564 aa  238  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  32.71 
 
 
542 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  36.38 
 
 
556 aa  230  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  32.36 
 
 
554 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  34.94 
 
 
548 aa  227  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  34.27 
 
 
546 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  34.57 
 
 
548 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  34.32 
 
 
546 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  33.52 
 
 
564 aa  222  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  35.85 
 
 
552 aa  222  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  31.39 
 
 
571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  30.89 
 
 
564 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  34.87 
 
 
564 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  30.93 
 
 
574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  29.91 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  31.4 
 
 
564 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  30.76 
 
 
608 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  30.65 
 
 
628 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  31.01 
 
 
624 aa  210  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  31.07 
 
 
573 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  30.68 
 
 
624 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  30.57 
 
 
563 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  30.28 
 
 
608 aa  208  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  30.41 
 
 
629 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  30.66 
 
 
608 aa  206  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  29.64 
 
 
598 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  29.79 
 
 
613 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  30.47 
 
 
585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  31.73 
 
 
555 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  30.81 
 
 
581 aa  179  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 
525 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
296 aa  161  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
294 aa  141  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
294 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  31.48 
 
 
310 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.01 
 
 
308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
294 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
298 aa  131  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
299 aa  131  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  33.59 
 
 
300 aa  130  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
301 aa  128  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
293 aa  127  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
300 aa  127  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
339 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
339 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  29.7 
 
 
318 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
301 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
300 aa  126  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
320 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
291 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
303 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  33.59 
 
 
301 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
290 aa  122  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
302 aa  121  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
302 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
297 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
295 aa  118  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
297 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
296 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
296 aa  108  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.46 
 
 
514 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  23.78 
 
 
553 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 
551 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
558 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  23.84 
 
 
498 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1133  hypothetical protein  23.83 
 
 
485 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.97 
 
 
543 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.02 
 
 
520 aa  99.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 
584 aa  99.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1128  hypothetical protein  24.36 
 
 
485 aa  98.2  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  22.8 
 
 
557 aa  97.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  26.74 
 
 
576 aa  97.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 
577 aa  97.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  26.91 
 
 
555 aa  96.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2611  amino acid adenylation  26.67 
 
 
614 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335751  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 
636 aa  95.1  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 
500 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  21.72 
 
 
662 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 
530 aa  94  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  26.1 
 
 
522 aa  93.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 
561 aa  92.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 
518 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 
517 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  22.9 
 
 
564 aa  92.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  24.27 
 
 
647 aa  92  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 
519 aa  92  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 
518 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  26.99 
 
 
539 aa  91.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>