More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2384 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 522 aa  1070    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  49.49 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  48.63 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 521 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 		 526 aa  326  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 527 aa  326  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 538 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  37.28 
 
 		 529 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  36.5 
 
 		 532 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 531 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  36.38 
 
 		 530 aa  289  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 505 aa  286  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 529 aa  278  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.22 
 
 		 514 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 524 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.08 
 
 		 536 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.28 
 
 		 539 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 524 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.94 
 
 		 527 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.14 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 526 aa  250  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 691 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 608 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3059  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000983491 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 522 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.03 
 
 		 561 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 523 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 		 582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 662 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 510 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.66 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 		 563 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 		 563 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.66 
 
 		 563 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 		 563 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 534 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 561 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 561 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.82 
 
 		 555 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  29.45 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 530 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  28.74 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 549 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  28.79 
 
 		 541 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.27 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 514 aa  226  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>