More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0705 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1071    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
608 aa  1072    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  99.81 
 
 
691 aa  1074    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1071    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  65.98 
 
 
538 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1071    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  67.86 
 
 
539 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1071    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  66.16 
 
 
536 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  60.87 
 
 
529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  54.44 
 
 
538 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  54.69 
 
 
529 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 
529 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  54.14 
 
 
530 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  50.95 
 
 
553 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  51.7 
 
 
545 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  51.14 
 
 
533 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 
531 aa  485  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  51.69 
 
 
532 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  53.35 
 
 
524 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  51.43 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  52.76 
 
 
531 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  52.76 
 
 
531 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  52.95 
 
 
527 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  49.9 
 
 
522 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  49.9 
 
 
522 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  49.9 
 
 
522 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
522 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
522 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
522 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
522 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  48.79 
 
 
538 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  49.03 
 
 
510 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  47.68 
 
 
509 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  50.62 
 
 
509 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 
505 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 
505 aa  346  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 
505 aa  346  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 
514 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 
529 aa  317  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 
519 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 
515 aa  293  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
512 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
521 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  32.64 
 
 
522 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 
526 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
520 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
527 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
526 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 
520 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
516 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
497 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
530 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
418 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 
490 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  30.43 
 
 
541 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.7 
 
 
510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.81 
 
 
510 aa  220  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.7 
 
 
510 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.52 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.34 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.52 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.34 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.52 
 
 
510 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.07 
 
 
510 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.04 
 
 
510 aa  213  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.97 
 
 
510 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.83 
 
 
512 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
770 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  32.44 
 
 
516 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
523 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 
569 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
517 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.76 
 
 
2386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  31.1 
 
 
521 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.76 
 
 
561 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.76 
 
 
561 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.76 
 
 
561 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.76 
 
 
561 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
662 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 
534 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
523 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
585 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  29.92 
 
 
529 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 
559 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
564 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
506 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  29.55 
 
 
534 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
584 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
539 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 
511 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 
521 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 
525 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
509 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>