More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0555 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 534 aa  1092    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  90.62 
 
 		 534 aa  1000    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  53.83 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  33.46 
 
 		 983 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4719  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 		 495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 545 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143385  decreased coverage  0.00095166 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.83 
 
 		 2867 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.02 
 
 		 3291 aa  260  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.27 
 
 		 1142 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  32.57 
 
 		 2338 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  31.17 
 
 		 2571 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.17 
 
 		 2571 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.14 
 
 		 1776 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.03 
 
 		 2033 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.59 
 
 		 6676 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  34.27 
 
 		 2448 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  32.44 
 
 		 2336 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  33.98 
 
 		 2154 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.92 
 
 		 9498 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  32.25 
 
 		 2345 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  31.8 
 
 		 2054 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 		 2626 aa  247  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.33 
 
 		 2666 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 		 1336 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  33.52 
 
 		 1643 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.59 
 
 		 5422 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 		 2176 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  33.27 
 
 		 1383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.01 
 
 		 3002 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  31.02 
 
 		 3695 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.79 
 
 		 4882 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  31.75 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.87 
 
 		 2156 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 531 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.72 
 
 		 13537 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.5 
 
 		 5929 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  31.89 
 
 		 1518 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 8211 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.38 
 
 		 3498 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.59 
 
 		 1839 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.26 
 
 		 2883 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.69 
 
 		 6202 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1311  conserved hypothetical protein, putative amino acid adenylation domain protein  29.36 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000252805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  33.46 
 
 		 2625 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  30.28 
 
 		 888 aa  240  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.6 
 
 		 2156 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  33.58 
 
 		 4383 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.02 
 
 		 8646 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  32.58 
 
 		 3194 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  32.57 
 
 		 1110 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  30.67 
 
 		 1786 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.47 
 
 		 1556 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.46 
 
 		 2791 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.73 
 
 		 1833 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.76 
 
 		 2370 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.14 
 
 		 3331 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  33.91 
 
 		 1351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.63 
 
 		 1518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.52 
 
 		 1069 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  34.48 
 
 		 1405 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  33.82 
 
 		 4136 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0415  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  30.61 
 
 		 625 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.49 
 
 		 3308 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.25 
 
 		 2164 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  29.92 
 
 		 1193 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.12 
 
 		 9175 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  32.58 
 
 		 6176 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.16 
 
 		 4968 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  29.45 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 523 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  29.62 
 
 		 1193 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1496  amino acid adenylation domain-containing protein  29.49 
 
 		 502 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.89 
 
 		 5230 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  31.52 
 
 		 1518 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.65 
 
 		 4960 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.14 
 
 		 5596 aa  233  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.5 
 
 		 3021 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.72 
 
 		 5926 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  33.77 
 
 		 1321 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  32.44 
 
 		 1779 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  33.08 
 
 		 1082 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.08 
 
 		 4531 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.28 
 
 		 1556 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  31.95 
 
 		 1553 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 		 1578 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  33.14 
 
 		 2137 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  32.04 
 
 		 2395 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  29.04 
 
 		 2156 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 519 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.47 
 
 		 4960 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 529 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.64 
 
 		 3404 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  31.95 
 
 		 2875 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  32.89 
 
 		 1082 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.83 
 
 		 5738 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  32.31 
 
 		 1483 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  32.31 
 
 		 1483 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>