More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1930 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 510 aa  1018    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  64.48 
 
 		 509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  65.01 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  48.83 
 
 		 539 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 691 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 608 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  46.26 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  47.69 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  45.97 
 
 		 538 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  47.63 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 538 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  46.65 
 
 		 533 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  46.44 
 
 		 531 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  42.89 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  47 
 
 		 529 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  45.51 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 		 545 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  47.95 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  48.26 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  44.4 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  48.06 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  47.75 
 
 		 522 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  47.75 
 
 		 522 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  47.75 
 
 		 522 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  47.75 
 
 		 522 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  47.35 
 
 		 527 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 		 524 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 531 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 531 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  45.66 
 
 		 538 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  44.83 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 		 505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  44.02 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 523 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 519 aa  259  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 527 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 526 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 515 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  34.05 
 
 		 522 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 512 aa  247  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 521 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 526 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 490 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 418 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  27.8 
 
 		 541 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 490 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.81 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 523 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 506 aa  180  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.67 
 
 		 3404 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.42 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.82 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 510 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.13 
 
 		 533 aa  176  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 518 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  32.19 
 
 		 1668 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 492 aa  176  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  33.4 
 
 		 2187 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 495 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.24 
 
 		 5328 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 530 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.99 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 534 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  29.4 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.19 
 
 		 4336 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.97 
 
 		 2154 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 513 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  30.12 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>