More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3134 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 538 aa  1055    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  48.96 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  50.92 
 
 		 533 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  50.18 
 
 		 608 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  50.18 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  50.18 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  50.18 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  47.14 
 
 		 538 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  50.18 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  50 
 
 		 691 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  52.75 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  47.17 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  46.62 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  47 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  46.4 
 
 		 538 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  48.69 
 
 		 529 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  46.21 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  45.3 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  48.04 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  48.25 
 
 		 522 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  48.25 
 
 		 522 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  48.25 
 
 		 522 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  48.25 
 
 		 522 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  47.61 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  47.4 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  46.12 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  44.2 
 
 		 505 aa  327  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  43.99 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 505 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  45.33 
 
 		 509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  43.51 
 
 		 509 aa  309  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 523 aa  296  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 529 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 515 aa  270  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 519 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  33.87 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 527 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 520 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 525 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.95 
 
 		 503 aa  202  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.09 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.04 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 497 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  29.23 
 
 		 570 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.06 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.06 
 
 		 576 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 502 aa  191  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 509 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3059  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 491 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000983491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 540 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 532 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.66 
 
 		 510 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 508 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 559 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 1043 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  31.92 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 569 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 490 aa  183  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  31.23 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  28.79 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>