More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0542 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 534 aa  1096    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  90.62 
 
 		 534 aa  1000    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  53.26 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4719  amino acid adenylation domain protein  37.48 
 
 		 495 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  33.08 
 
 		 983 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.77 
 
 		 3291 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  32.76 
 
 		 2338 aa  263  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.08 
 
 		 1142 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  32.76 
 
 		 2336 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143385  decreased coverage  0.00095166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 		 1776 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  32.57 
 
 		 2345 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.64 
 
 		 2867 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 		 2626 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.9 
 
 		 13537 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.9 
 
 		 9498 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  33.46 
 
 		 2154 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.14 
 
 		 1839 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.22 
 
 		 6676 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.03 
 
 		 2033 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.52 
 
 		 2448 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31 
 
 		 2156 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  32.24 
 
 		 2176 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  34.53 
 
 		 1567 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  34.53 
 
 		 1567 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  32.76 
 
 		 2625 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.33 
 
 		 2666 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.39 
 
 		 3002 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  34.53 
 
 		 1567 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1311  conserved hypothetical protein, putative amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 		 498 aa  247  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000252805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.74 
 
 		 1336 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.74 
 
 		 2156 aa  246  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.14 
 
 		 8211 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  34.6 
 
 		 6176 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  31.21 
 
 		 1193 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 		 1110 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.98 
 
 		 3331 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  33.14 
 
 		 1643 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1042 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.23 
 
 		 5926 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  30.19 
 
 		 1193 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.37 
 
 		 8646 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  32.39 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  32.03 
 
 		 1556 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.27 
 
 		 4531 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  33.79 
 
 		 1383 aa  243  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.6 
 
 		 4968 aa  243  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  30.59 
 
 		 2054 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.08 
 
 		 2164 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.38 
 
 		 2883 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.46 
 
 		 2791 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  31.15 
 
 		 625 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.22 
 
 		 3308 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.44 
 
 		 5929 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  30.48 
 
 		 1786 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  30.49 
 
 		 888 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.9 
 
 		 3498 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 531 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.84 
 
 		 4960 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  31.88 
 
 		 1518 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.2 
 
 		 5422 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  30.64 
 
 		 3695 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.59 
 
 		 1789 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0415  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  33.58 
 
 		 3432 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.12 
 
 		 6202 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.84 
 
 		 1556 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.34 
 
 		 3086 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.65 
 
 		 4960 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1496  amino acid adenylation domain-containing protein  29.68 
 
 		 502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.283025  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.71 
 
 		 1069 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  32.33 
 
 		 2151 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1466  amino acid adenylation domain-containing protein  29.48 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.39 
 
 		 3086 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  32.31 
 
 		 2156 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  33.01 
 
 		 1779 aa  236  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.2 
 
 		 4882 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  30.84 
 
 		 2875 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.21 
 
 		 2370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  28.73 
 
 		 1194 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.14 
 
 		 5469 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 2137 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.59 
 
 		 3021 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.69 
 
 		 2571 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  34.41 
 
 		 1525 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 		 6999 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  29.69 
 
 		 2571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.44 
 
 		 1518 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  32.5 
 
 		 1130 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  30.23 
 
 		 9175 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 529 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513768  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  32.45 
 
 		 1574 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  34.33 
 
 		 2155 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.49 
 
 		 5328 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  31.64 
 
 		 3194 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.65 
 
 		 5596 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.14 
 
 		 4383 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>