More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3426 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 505 aa  986    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  93.07 
 
 		 505 aa  918    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  98.42 
 
 		 505 aa  969    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  47.92 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  45.58 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  45.66 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 		 545 aa  346  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 691 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  44.29 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  42.12 
 
 		 539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 538 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  43.06 
 
 		 524 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  44.57 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  44.02 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  44.53 
 
 		 509 aa  325  9e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 		 538 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 529 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 523 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  42.45 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  41.11 
 
 		 536 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  45.77 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  41.3 
 
 		 523 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  42.43 
 
 		 522 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 		 514 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 522 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  42.23 
 
 		 522 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  42.23 
 
 		 522 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  42.23 
 
 		 522 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  42.23 
 
 		 522 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 522 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  36.42 
 
 		 522 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 		 529 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 512 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 526 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 527 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 521 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 526 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 520 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  31.65 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 516 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 513 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 499 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 513 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 563 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 563 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 561 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.53 
 
 		 561 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  32.17 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 565 aa  206  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.81 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.27 
 
 		 514 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 551 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  33.46 
 
 		 534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5806  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 562 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154251  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.35 
 
 		 5372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 551 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  34.08 
 
 		 1314 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 574 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.38 
 
 		 4383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.76 
 
 		 6676 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.18 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>