More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4497 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 517 aa  1054    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  45.8 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 526 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 530 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 520 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 		 523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 534 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 523 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 519 aa  240  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 505 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 523 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  32.35 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 515 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 538 aa  223  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 529 aa  220  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 523 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 		 510 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 		 510 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.86 
 
 		 510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 553 aa  216  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 		 510 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.29 
 
 		 492 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.67 
 
 		 529 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 691 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.81 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 608 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 561 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 535 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 535 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 662 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 535 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 535 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.11 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.87 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 559 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 532 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 524 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 546 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 		 496 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 		 496 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.17 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.46 
 
 		 536 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.75 
 
 		 530 aa  199  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.59 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.1 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  36.18 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  29.32 
 
 		 522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 531 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 529 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 526 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 531 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  30.6 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  29.33 
 
 		 517 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.99 
 
 		 508 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.64 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 516 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.08 
 
 		 514 aa  192  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 539 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.66 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>