More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 516 aa  1039    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  73.52 
 
 		 509 aa  732    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  56.26 
 
 		 522 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  56.61 
 
 		 533 aa  541  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  54.29 
 
 		 517 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5576  acyl-CoA synthetase  56.18 
 
 		 519 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  54.01 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  49.41 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  49.42 
 
 		 530 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  48.34 
 
 		 520 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  47.35 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  48.94 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  49.9 
 
 		 534 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  47.95 
 
 		 529 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  44.55 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  44.55 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  44.55 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 		 520 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.8 
 
 		 503 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 518 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 1043 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 534 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 534 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 		 525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 520 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 538 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.23 
 
 		 517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.23 
 
 		 517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.23 
 
 		 517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 518 aa  309  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 		 502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 499 aa  306  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 		 518 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.69 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.92 
 
 		 518 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 519 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.92 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 		 524 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 		 512 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 508 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.69 
 
 		 518 aa  293  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.33 
 
 		 526 aa  293  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.69 
 
 		 518 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.69 
 
 		 518 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.69 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.69 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 546 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 528 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.06 
 
 		 530 aa  290  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 525 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 514 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 662 aa  289  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 556 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 556 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 556 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 521 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.23 
 
 		 526 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0800  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 539 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 523 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 521 aa  286  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 534 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 524 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 534 aa  283  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.32 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.77 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.94 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.56 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 518 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 512 aa  279  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 		 579 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 539 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 525 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>