More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3158 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
490 aa  1009    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  51.35 
 
 
497 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  53.1 
 
 
418 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 
517 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
520 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
526 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
520 aa  309  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  45.98 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  42.9 
 
 
523 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 
534 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 
523 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 
521 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
538 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
512 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
523 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.93 
 
 
492 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
514 aa  233  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
531 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  29.43 
 
 
530 aa  226  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 
533 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  29.98 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  29.98 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  29.98 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  29.98 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  29.98 
 
 
608 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  29.98 
 
 
691 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
505 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 
510 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 
512 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 
510 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.71 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.14 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 
505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  30.31 
 
 
508 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
662 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.16 
 
 
510 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 
510 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 
553 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
526 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
505 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.26 
 
 
510 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
529 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
531 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
531 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.17 
 
 
527 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.81 
 
 
514 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
860 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 
545 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
538 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
502 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
862 aa  203  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.08 
 
 
532 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  32.98 
 
 
522 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  32.98 
 
 
522 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
522 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.76 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  26.65 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 
498 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.19 
 
 
503 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
511 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 
520 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
495 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.63 
 
 
514 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
516 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
522 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
522 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
496 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
522 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
830 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
522 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
830 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 
531 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  33.82 
 
 
514 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  27.97 
 
 
536 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  28.99 
 
 
496 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 
559 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 
830 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 
499 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 
460 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 
523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.43 
 
 
539 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.69 
 
 
529 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 
506 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
521 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 
510 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 
526 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
527 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
503 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>