More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0267 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  100 
 
 		 492 aa  1002    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 		 523 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  40.06 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 490 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 497 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 630 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 538 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 570 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  25.75 
 
 		 557 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  31.29 
 
 		 578 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 		 531 aa  166  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.22 
 
 		 544 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 887 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 499 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  24.26 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.86 
 
 		 587 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.03 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 843 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.28 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  24.14 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  24.14 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  24.14 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.98 
 
 		 552 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.29 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  30.9 
 
 		 576 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 505 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  29.14 
 
 		 575 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 526 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  26.55 
 
 		 533 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.99 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 506 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 511 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.61 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.84 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.98 
 
 		 549 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  31.29 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  32.75 
 
 		 560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 841 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  28.15 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  29.29 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 506 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  30.83 
 
 		 548 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 525 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.57 
 
 		 490 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  28.86 
 
 		 575 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.65 
 
 		 503 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  26.76 
 
 		 514 aa  153  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  23.75 
 
 		 529 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.04 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 565 aa  153  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 508 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.09 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  29.29 
 
 		 560 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.92 
 
 		 1833 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  29.88 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>