More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1553 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 495 aa  1023    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  54.36 
 
 		 493 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  54.16 
 
 		 493 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  53.25 
 
 		 498 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  44.33 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  38.48 
 
 		 536 aa  324  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 504 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  36.98 
 
 		 512 aa  293  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  35.09 
 
 		 526 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  35.88 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  34.79 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  34.5 
 
 		 505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  34.22 
 
 		 503 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  35.12 
 
 		 508 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  34.36 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  36.27 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  34.95 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  34.09 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  34.92 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  34.3 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  34.57 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  35.6 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  34.92 
 
 		 510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.98 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  34.28 
 
 		 511 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  36.42 
 
 		 504 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  38.35 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  33.8 
 
 		 503 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  34.09 
 
 		 503 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  34.06 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  33.2 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  34.36 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  36.06 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  34.64 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 507 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  34.15 
 
 		 519 aa  256  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  35.21 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  34.66 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  35.31 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  33.06 
 
 		 506 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  35.1 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  34.89 
 
 		 539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  34.21 
 
 		 530 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  38.18 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  35.1 
 
 		 507 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  35.53 
 
 		 517 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  33.86 
 
 		 517 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03417  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01530)  34.44 
 
 		 634 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal  0.046115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  34.66 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  39.72 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  33.13 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  38.89 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  33.26 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  34.05 
 
 		 547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  35.57 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 521 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 478 aa  239  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 501 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 561 aa  236  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 501 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.55 
 
 		 583 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  38.3 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  38.18 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  38.03 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 525 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.19 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  37.08 
 
 		 472 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 662 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.81 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  32.66 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 		 562 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.11 
 
 		 562 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 508 aa  220  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 		 510 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  31.6 
 
 		 501 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 577 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 		 510 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.88 
 
 		 510 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>