More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2136 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  98.38 
 
 		 493 aa  995    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  70.2 
 
 		 502 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  62.27 
 
 		 498 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 493 aa  1011    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  54.36 
 
 		 495 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  47.59 
 
 		 533 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  42.1 
 
 		 536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 553 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  37.95 
 
 		 512 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  35.26 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 507 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  35.63 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  35.34 
 
 		 509 aa  289  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  34.92 
 
 		 505 aa  289  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  34.96 
 
 		 508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  35.86 
 
 		 504 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  34.74 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  35.13 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  35.25 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  35.36 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  33.87 
 
 		 507 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  34.25 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  33.53 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  34.19 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  35.84 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  35.26 
 
 		 506 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  35.4 
 
 		 536 aa  276  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  35.05 
 
 		 519 aa  276  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  34.31 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  32.81 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  34.85 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  35.65 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  38.9 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 507 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  35.18 
 
 		 530 aa  269  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  35.83 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  35.57 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  34.54 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03417  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01530)  35.92 
 
 		 634 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal  0.046115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  34 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  34.89 
 
 		 510 aa  266  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  34.64 
 
 		 539 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  34.66 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  35.07 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  34.84 
 
 		 510 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  34.7 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  35.21 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  34.39 
 
 		 509 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  40.14 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  33.27 
 
 		 547 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  35.27 
 
 		 501 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  35.21 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  34.99 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 472 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  35.27 
 
 		 501 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  32.64 
 
 		 507 aa  249  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  34.86 
 
 		 469 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 501 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.08 
 
 		 514 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 466 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06766  conserved hypothetical protein  35.21 
 
 		 579 aa  236  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.9618  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.33 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 518 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 499 aa  233  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.01 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 512 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 540 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 546 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 		 662 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1436  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313554  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  34.09 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 490 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 536 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  39.83 
 
 		 472 aa  226  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 518 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 569 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  36.53 
 
 		 498 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>