More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4311 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 477 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.16 
 
 		 478 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.46 
 
 		 483 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.46 
 
 		 483 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.46 
 
 		 483 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  73.91 
 
 		 490 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  51.85 
 
 		 524 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.45 
 
 		 546 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.89 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.4 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.4 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.4 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.39 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  49.59 
 
 		 489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  48.51 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.74 
 
 		 523 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  50.63 
 
 		 511 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  47.49 
 
 		 510 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.8 
 
 		 512 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  48.1 
 
 		 508 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  44.81 
 
 		 523 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.17 
 
 		 528 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 		 552 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.7 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  43.59 
 
 		 533 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 543 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  40.81 
 
 		 522 aa  359  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  36.86 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 553 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 549 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.19 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 544 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 530 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  34.09 
 
 		 560 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.82 
 
 		 552 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 518 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.62 
 
 		 552 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 560 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.9 
 
 		 560 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 508 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 630 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.84 
 
 		 587 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.9 
 
 		 560 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.9 
 
 		 549 aa  282  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 513 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  35.56 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  35.28 
 
 		 546 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 843 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.84 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  36.52 
 
 		 547 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 503 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  35.84 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  34.5 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 541 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 521 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  35.84 
 
 		 562 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 576 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.84 
 
 		 579 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 576 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 576 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 511 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 554 aa  276  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  34.5 
 
 		 540 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 557 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  34.5 
 
 		 540 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.78 
 
 		 550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 566 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  34.91 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 558 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  33.92 
 
 		 546 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 551 aa  273  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.6 
 
 		 549 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 539 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 565 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 571 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.32 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  34.76 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  34.78 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  33.72 
 
 		 546 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 511 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 		 539 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>