More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1480 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.54 
 
 		 507 aa  734    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  80.55 
 
 		 506 aa  821    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.9 
 
 		 523 aa  902    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  80.55 
 
 		 506 aa  821    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 512 aa  1035    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  80.55 
 
 		 506 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  56.69 
 
 		 523 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  55.91 
 
 		 508 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  53.86 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  56.18 
 
 		 510 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  55.64 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  51.58 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.54 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.78 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.49 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  50.87 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  48.73 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  46.23 
 
 		 522 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.58 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.2 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.78 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.27 
 
 		 483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.27 
 
 		 483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.27 
 
 		 483 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 545 aa  346  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 543 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.33 
 
 		 549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.33 
 
 		 549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 553 aa  316  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  35.4 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 843 aa  299  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  36.12 
 
 		 576 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 562 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  35.51 
 
 		 557 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.43 
 
 		 557 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  35.45 
 
 		 570 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 574 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  35.24 
 
 		 562 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.2 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 662 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  35.67 
 
 		 578 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  36.9 
 
 		 538 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  36.59 
 
 		 538 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 544 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 525 aa  286  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 558 aa  286  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 508 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.68 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 550 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  34.68 
 
 		 560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  36.47 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 570 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  36.49 
 
 		 561 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  35.19 
 
 		 560 aa  283  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 544 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  36.47 
 
 		 540 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  34.16 
 
 		 573 aa  282  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  36.47 
 
 		 540 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  34.82 
 
 		 576 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  34.9 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 548 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 575 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.67 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.91 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  34.9 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 		 549 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 		 587 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 550 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 570 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.91 
 
 		 564 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.63 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 574 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 570 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 		 546 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 576 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.85 
 
 		 575 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 565 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  32.83 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  32.83 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  32.83 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>