More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3668 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
483 aa  975    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  98.55 
 
 
483 aa  959    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  87.34 
 
 
478 aa  837    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  98.55 
 
 
483 aa  959    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  86.63 
 
 
490 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.46 
 
 
477 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.37 
 
 
546 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.02 
 
 
510 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  50.78 
 
 
524 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  48.33 
 
 
512 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.65 
 
 
526 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.94 
 
 
506 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.94 
 
 
506 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  49.18 
 
 
489 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.94 
 
 
506 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  48.9 
 
 
510 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  49.09 
 
 
510 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  49.7 
 
 
508 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  48.63 
 
 
511 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  45.49 
 
 
523 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.52 
 
 
523 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.47 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.44 
 
 
528 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  42.54 
 
 
552 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46 
 
 
507 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  43.7 
 
 
533 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
543 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
522 aa  352  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  40.76 
 
 
545 aa  343  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 
530 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  35.78 
 
 
544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 
518 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.48 
 
 
549 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 
551 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
539 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  37.3 
 
 
547 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
544 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.48 
 
 
552 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.67 
 
 
549 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 
560 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 
560 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 
540 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  36.53 
 
 
539 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 
552 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 
561 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 
553 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 
547 aa  289  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 
540 aa  290  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 
540 aa  290  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  35.66 
 
 
552 aa  289  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
630 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.9 
 
 
560 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
554 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 
843 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.58 
 
 
549 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.85 
 
 
565 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 
543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 
560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 
564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 
560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
1043 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.46 
 
 
579 aa  282  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 
549 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 
550 aa  279  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
576 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
576 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
576 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 
550 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.47 
 
 
513 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 
557 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
576 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
576 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
570 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 
576 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  35.11 
 
 
562 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 
495 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.73 
 
 
538 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
542 aa  276  8e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 
587 aa  276  8e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 
557 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.04 
 
 
562 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 
576 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 
566 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  34.52 
 
 
575 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
508 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
513 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 
578 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  34.67 
 
 
538 aa  272  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  33.65 
 
 
557 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 
575 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
525 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 
570 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
566 aa  272  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
566 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
550 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
506 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.19 
 
 
514 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 
549 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>