More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2861 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  87.87 
 
 		 510 aa  863    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 508 aa  1015    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.74 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.74 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.74 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  58.19 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.2 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  54.03 
 
 		 523 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.51 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  51.59 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.49 
 
 		 507 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  51.3 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  50.91 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.12 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.73 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  50.19 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.65 
 
 		 526 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.4 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.1 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.1 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.7 
 
 		 483 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  49.31 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.82 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.99 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.1 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  44.99 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  42.22 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 		 545 aa  346  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 543 aa  325  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 		 549 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  36.13 
 
 		 549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 544 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.27 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.53 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  36.53 
 
 		 549 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 570 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 843 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 560 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  36.49 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 554 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  34.56 
 
 		 539 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 544 aa  289  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 552 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 539 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 548 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 558 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 539 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 550 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.14 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 521 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 550 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 571 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.18 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  35.21 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  33.78 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.4 
 
 		 543 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  32.67 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  34.93 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 563 aa  280  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  34.69 
 
 		 562 aa  280  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  33.84 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 562 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 662 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 630 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 562 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 557 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  36.07 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  32.53 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.93 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  33.9 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 569 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 558 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 506 aa  276  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 		 512 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  32.94 
 
 		 560 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 1043 aa  276  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  33.13 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  33.13 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  31.94 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  32.93 
 
 		 560 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 557 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  32.23 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  32.93 
 
 		 560 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.12 
 
 		 828 aa  274  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  31.59 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  34.3 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 566 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>