More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4008 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  67.48 
 
 		 530 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  59.78 
 
 		 542 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  58.69 
 
 		 546 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  73.08 
 
 		 538 aa  831    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  75.61 
 
 		 540 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  65.36 
 
 		 551 aa  733    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  57.2 
 
 		 546 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  58.92 
 
 		 541 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  61.97 
 
 		 550 aa  698    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  59.07 
 
 		 546 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  60.37 
 
 		 546 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  64.94 
 
 		 544 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  63.28 
 
 		 552 aa  723    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  75.79 
 
 		 540 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  59.25 
 
 		 547 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  75.79 
 
 		 540 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  64.07 
 
 		 549 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  75.86 
 
 		 538 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  58.27 
 
 		 558 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 1043 aa  2133    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  56.65 
 
 		 558 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  70.28 
 
 		 539 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  61.38 
 
 		 545 aa  649    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  55.13 
 
 		 560 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  54.86 
 
 		 576 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  53.43 
 
 		 566 aa  616  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  54.77 
 
 		 564 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  56.61 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  55.5 
 
 		 557 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  52.05 
 
 		 542 aa  612  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  54.89 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  55.14 
 
 		 562 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  54.71 
 
 		 565 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  54.43 
 
 		 577 aa  611  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  55.12 
 
 		 564 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  55.66 
 
 		 564 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  54.87 
 
 		 564 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  54.77 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  54.2 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  53.89 
 
 		 579 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  55.05 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  54.94 
 
 		 576 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  53.33 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  55.68 
 
 		 561 aa  602  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  54.46 
 
 		 560 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  53.06 
 
 		 576 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  53.64 
 
 		 578 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  54.28 
 
 		 560 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  54.68 
 
 		 560 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  54.76 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  53.9 
 
 		 576 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  52.17 
 
 		 562 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  54.03 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  54.1 
 
 		 560 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  53.64 
 
 		 578 aa  598  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  50.51 
 
 		 596 aa  593  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  54.66 
 
 		 543 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  53.65 
 
 		 601 aa  595  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  55.72 
 
 		 550 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  53.24 
 
 		 575 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  53.61 
 
 		 566 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 566 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  54.94 
 
 		 539 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  53.42 
 
 		 575 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  51.8 
 
 		 576 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  53.06 
 
 		 575 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  52.01 
 
 		 571 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  52.19 
 
 		 571 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  51.62 
 
 		 576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  53.24 
 
 		 575 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  53.24 
 
 		 575 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  50.27 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  52.88 
 
 		 575 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  50.27 
 
 		 584 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  51.62 
 
 		 579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  50.53 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  54.2 
 
 		 596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  51.17 
 
 		 570 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  51.38 
 
 		 552 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  51.89 
 
 		 571 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  51.17 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  50.37 
 
 		 574 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  46.97 
 
 		 605 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 		 566 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  51.84 
 
 		 544 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  50.46 
 
 		 552 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  54.35 
 
 		 518 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 		 570 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  50.46 
 
 		 570 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 		 574 aa  555  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  51.28 
 
 		 573 aa  555  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 		 560 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>