More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2768 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 489 aa  964    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.57 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.57 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.57 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.62 
 
 		 523 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  58.19 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  56.19 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.45 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  53.22 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  53.91 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.87 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  53.08 
 
 		 552 aa  491  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.68 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 477 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.18 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.18 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.59 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.18 
 
 		 483 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.48 
 
 		 490 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.06 
 
 		 526 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.79 
 
 		 546 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  49.8 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  49.8 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  46.37 
 
 		 533 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.15 
 
 		 528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  44.67 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 543 aa  340  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 545 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 544 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 544 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.81 
 
 		 549 aa  293  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 530 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 		 549 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  32.46 
 
 		 552 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 549 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  36.44 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  35.84 
 
 		 539 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.78 
 
 		 543 aa  282  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 553 aa  282  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 518 aa  282  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 552 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  35.86 
 
 		 564 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 546 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  34.99 
 
 		 552 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  30.96 
 
 		 579 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 570 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.57 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  34.39 
 
 		 557 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 560 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  34.11 
 
 		 546 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  34.88 
 
 		 546 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 554 aa  276  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 562 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  32.33 
 
 		 574 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 558 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 578 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 560 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 573 aa  273  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  34.27 
 
 		 549 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  34.88 
 
 		 540 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.09 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 630 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  34.88 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  34.88 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  34.53 
 
 		 571 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  34.79 
 
 		 557 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 541 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.63 
 
 		 549 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 1043 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 562 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 560 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 560 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 843 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 575 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.97 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.11 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 566 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  34.27 
 
 		 575 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  33.81 
 
 		 548 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 538 aa  266  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 560 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 558 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  31.74 
 
 		 578 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 550 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>