More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13594 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.54 
 
 		 512 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 507 aa  1017    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.4 
 
 		 506 aa  769    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.4 
 
 		 506 aa  769    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.57 
 
 		 523 aa  784    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.4 
 
 		 506 aa  769    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  56.39 
 
 		 523 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  54.98 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  57.49 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  56.06 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  54.49 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  55.27 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  52.78 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  51.08 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.09 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.87 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.04 
 
 		 526 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.11 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  46.23 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.7 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.74 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.06 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46 
 
 		 483 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46 
 
 		 483 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 545 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 543 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  36.09 
 
 		 552 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  36.09 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.9 
 
 		 549 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.96 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 843 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 549 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.59 
 
 		 550 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 		 548 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  36.62 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  38.34 
 
 		 538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 554 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  34.9 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  36.05 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.67 
 
 		 557 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.83 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  35.86 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  34.89 
 
 		 570 aa  299  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 565 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  34.7 
 
 		 574 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  32.58 
 
 		 547 aa  298  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  34.51 
 
 		 570 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  36.42 
 
 		 538 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  32.52 
 
 		 550 aa  296  5e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  34.72 
 
 		 560 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.96 
 
 		 560 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.65 
 
 		 544 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  34.96 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 548 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 552 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 570 aa  292  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 		 560 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  35.27 
 
 		 571 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  35.33 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  34.59 
 
 		 573 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 562 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  34.45 
 
 		 576 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  35.22 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 550 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 		 564 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 561 aa  286  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  32.14 
 
 		 549 aa  286  8e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.65 
 
 		 560 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  36.42 
 
 		 539 aa  286  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  35.03 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  34.68 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.18 
 
 		 561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  32.33 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  34.23 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 579 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  34.29 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 544 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  38 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  35.47 
 
 		 564 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  31.39 
 
 		 549 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.07 
 
 		 549 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  34.83 
 
 		 570 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>