More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2525 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.16 
 
 		 477 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  87.76 
 
 		 483 aa  841    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  87.34 
 
 		 483 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 478 aa  962    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  87.76 
 
 		 483 aa  841    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  89.68 
 
 		 490 aa  871    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.91 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.98 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.98 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.98 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.29 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  50.6 
 
 		 511 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  49.59 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  48.98 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  47.26 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47 
 
 		 526 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  45.26 
 
 		 523 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.95 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.68 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.52 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.59 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 543 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  41.89 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  40.13 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 		 544 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.91 
 
 		 549 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.31 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  33.97 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 518 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.35 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 530 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 560 aa  280  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.41 
 
 		 561 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 553 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  32.57 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  32.57 
 
 		 560 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 564 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 630 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 843 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 541 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  32 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  35.18 
 
 		 539 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 550 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 542 aa  269  8e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 1043 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 		 513 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.63 
 
 		 552 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 544 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.7 
 
 		 557 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  34.9 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  33.93 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.04 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.72 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 566 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  33.73 
 
 		 540 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 562 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.7 
 
 		 579 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  32.68 
 
 		 549 aa  263  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 578 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  31.46 
 
 		 550 aa  262  8e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 570 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.68 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  33.6 
 
 		 546 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  32.5 
 
 		 549 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.85 
 
 		 515 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  32.3 
 
 		 549 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.09 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 566 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  32.76 
 
 		 562 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.09 
 
 		 510 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>