More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1417 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  66.48 
 
 		 526 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 528 aa  1068    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.19 
 
 		 546 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.05 
 
 		 510 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.84 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.54 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.71 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  50.95 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  51.46 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.71 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.71 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  50.5 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.87 
 
 		 507 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  49.26 
 
 		 552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  47.3 
 
 		 523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  45.75 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  46.58 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 		 510 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.39 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.17 
 
 		 477 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.08 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.08 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.78 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.32 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 543 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 550 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  39.29 
 
 		 544 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  37.03 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  35.27 
 
 		 552 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  36.62 
 
 		 549 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  37.23 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  35.62 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.69 
 
 		 549 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 843 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  36.44 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 		 544 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 562 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  35.84 
 
 		 552 aa  325  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  36.63 
 
 		 557 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  38.79 
 
 		 539 aa  323  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 558 aa  323  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  38.46 
 
 		 549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 554 aa  316  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 550 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  35.32 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  34.93 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  36.4 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 		 570 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.55 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  35.05 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 558 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 513 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 		 530 aa  309  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.46 
 
 		 828 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 1043 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.74 
 
 		 564 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 550 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 566 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  35.7 
 
 		 546 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.18 
 
 		 561 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  34.27 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  33.73 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  34.06 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 549 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 538 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  34.58 
 
 		 596 aa  299  8e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 563 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 545 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 566 aa  296  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 574 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 542 aa  293  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 506 aa  293  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  35.7 
 
 		 549 aa  293  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  35.95 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  35.76 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  35.95 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  34.95 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.45 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  34.32 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.49 
 
 		 518 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  35.09 
 
 		 546 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 540 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>