More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7124 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 540 aa  1108    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7114  AMP-dependent synthetase and ligase  48.73 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  35.78 
 
 		 552 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 552 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  34.73 
 
 		 550 aa  326  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.83 
 
 		 549 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 550 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.02 
 
 		 549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  35.93 
 
 		 544 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 549 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  34.06 
 
 		 549 aa  319  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  34.05 
 
 		 547 aa  318  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 549 aa  316  7e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 566 aa  310  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 553 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  33.95 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 571 aa  307  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 561 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 1043 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 524 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 630 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 546 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 		 546 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  33.79 
 
 		 568 aa  299  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  36 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 546 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 572 aa  296  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 843 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 550 aa  292  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 538 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 538 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 540 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  32.63 
 
 		 605 aa  286  9e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 566 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.48 
 
 		 526 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 560 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 560 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 566 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  35.04 
 
 		 575 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.8 
 
 		 828 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 576 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.47 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  34.52 
 
 		 575 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  34.48 
 
 		 576 aa  279  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2266  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 		 575 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 		 575 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  32.82 
 
 		 561 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  31.94 
 
 		 560 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 576 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 570 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.84 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 511 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.48 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 571 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 577 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  32.68 
 
 		 564 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.68 
 
 		 605 aa  269  8e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 512 aa  269  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 562 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  32.63 
 
 		 539 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 579 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  32.27 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  33.9 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  31.34 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  32.64 
 
 		 571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>