More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3306 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 511 aa  1016    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.52 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  54.34 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  51.26 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.02 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.39 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.39 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.39 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.46 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.6 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  49.31 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.22 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.22 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.63 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  49.11 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.43 
 
 		 490 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.79 
 
 		 523 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.88 
 
 		 477 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.95 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.47 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  43.52 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  49.8 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.09 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 		 523 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  47.08 
 
 		 552 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  46.17 
 
 		 510 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  47.78 
 
 		 543 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 545 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  37.1 
 
 		 544 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  38.3 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  37.92 
 
 		 549 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  38.11 
 
 		 560 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 		 552 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  36.6 
 
 		 552 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  34.65 
 
 		 549 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 553 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  39.43 
 
 		 561 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 		 550 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  35.47 
 
 		 552 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  35.78 
 
 		 560 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  38.2 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  35.26 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  40 
 
 		 549 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  35.4 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  35.22 
 
 		 560 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  36.13 
 
 		 546 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  36.09 
 
 		 562 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  35.22 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  37.58 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  38.56 
 
 		 564 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  37.58 
 
 		 564 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 		 551 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  39.25 
 
 		 565 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  35.91 
 
 		 546 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 843 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  37.5 
 
 		 557 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  35.91 
 
 		 546 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  37.2 
 
 		 557 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  37.94 
 
 		 543 aa  310  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  35.28 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  37.92 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  34.97 
 
 		 578 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  35.78 
 
 		 571 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 		 564 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 562 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  35.48 
 
 		 571 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 566 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  34.84 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.47 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.09 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  36.43 
 
 		 572 aa  300  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 506 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 578 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  32.27 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  35.74 
 
 		 546 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  35.57 
 
 		 518 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 544 aa  297  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 		 550 aa  296  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 579 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  34.86 
 
 		 571 aa  296  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  35.47 
 
 		 576 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 602 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  35.09 
 
 		 540 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 511 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  35.35 
 
 		 539 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  32.53 
 
 		 547 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  30.89 
 
 		 587 aa  293  5e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  35.88 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>