More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2126 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 546 aa  1125    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.25 
 
 		 526 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.62 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.67 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.61 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.61 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.61 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  46.3 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.18 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.3 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.45 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  46.12 
 
 		 508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.37 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.37 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.37 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.72 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  44.64 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.9 
 
 		 507 aa  445  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  46.4 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  43.95 
 
 		 522 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.29 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 		 533 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 543 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 545 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 544 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  34.71 
 
 		 560 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  34.41 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 565 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  34.1 
 
 		 560 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  34.59 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.18 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.47 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  34.47 
 
 		 561 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.05 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  33.93 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 		 564 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 553 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  32.46 
 
 		 548 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 843 aa  301  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 566 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  32.45 
 
 		 568 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 547 aa  297  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 574 aa  296  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 570 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.88 
 
 		 549 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  32.85 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 578 aa  293  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  32.83 
 
 		 570 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 558 aa  293  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 		 579 aa  293  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  33.47 
 
 		 552 aa  293  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 550 aa  292  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  32.03 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  32.15 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  33.93 
 
 		 605 aa  292  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  32.8 
 
 		 560 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 549 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.25 
 
 		 579 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 1043 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.93 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 630 aa  290  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  32.56 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  33.01 
 
 		 518 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  33.01 
 
 		 543 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 574 aa  286  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.87 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.26 
 
 		 828 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 573 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  30.98 
 
 		 548 aa  282  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  32.45 
 
 		 570 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.89 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  31.26 
 
 		 576 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  34.06 
 
 		 579 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  31.85 
 
 		 601 aa  280  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 570 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 570 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 570 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  31.32 
 
 		 570 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.99 
 
 		 570 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  31.77 
 
 		 568 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>