More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2101 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 543 aa  1063    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  48.22 
 
 		 545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  47.69 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.59 
 
 		 526 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.42 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.73 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.64 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.2 
 
 		 546 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.46 
 
 		 478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.42 
 
 		 477 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 533 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  42.69 
 
 		 512 aa  349  7e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.94 
 
 		 506 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.94 
 
 		 506 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.94 
 
 		 506 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 552 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.36 
 
 		 528 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 		 523 aa  343  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 510 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.56 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.11 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.56 
 
 		 507 aa  315  9e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 		 522 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 544 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 843 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.58 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 562 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 513 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  34.03 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 552 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.47 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  34.2 
 
 		 576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  32.27 
 
 		 560 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  36.94 
 
 		 564 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 		 548 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.74 
 
 		 561 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.33 
 
 		 549 aa  279  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.27 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 566 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 		 549 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  36.43 
 
 		 565 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.58 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 549 aa  276  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 550 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 		 562 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 549 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 558 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  32.4 
 
 		 550 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 549 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.4 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  31.4 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  32.1 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.57 
 
 		 564 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  33.6 
 
 		 564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 549 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  31.7 
 
 		 571 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  31.89 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  31.76 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.88 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 539 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 550 aa  267  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 562 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  32.52 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 550 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 575 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.33 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  32.16 
 
 		 561 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  35.42 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  32.63 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 570 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 575 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 575 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  30.94 
 
 		 565 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 575 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>