More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0867 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 543 aa  1104    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  38.36 
 
 		 544 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  35.95 
 
 		 560 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  36.78 
 
 		 549 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  37.4 
 
 		 552 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  38.94 
 
 		 562 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 562 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  36.14 
 
 		 549 aa  349  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 843 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  36.7 
 
 		 564 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.31 
 
 		 828 aa  348  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  36.14 
 
 		 549 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  37.89 
 
 		 571 aa  346  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  34.27 
 
 		 550 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  35.81 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  36.01 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  36.42 
 
 		 552 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  35.34 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  36.9 
 
 		 576 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 575 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  37.14 
 
 		 557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  37.78 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  36.21 
 
 		 575 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  35.83 
 
 		 570 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  36.65 
 
 		 571 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  37.52 
 
 		 546 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  35.02 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  37.69 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  35.85 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  35.85 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  36.42 
 
 		 573 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  37.74 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  35.39 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  38.58 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  36.03 
 
 		 575 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 576 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  36.65 
 
 		 571 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  38.58 
 
 		 577 aa  340  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  36.03 
 
 		 578 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  37.55 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  37.5 
 
 		 576 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  36.93 
 
 		 560 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 570 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  35.74 
 
 		 564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  36.85 
 
 		 576 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  35.99 
 
 		 575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  34.88 
 
 		 552 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 576 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 576 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 576 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  36.21 
 
 		 576 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 570 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  36.71 
 
 		 546 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 576 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 576 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 576 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  37.38 
 
 		 564 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  36.84 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 566 aa  333  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  35.11 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  35.73 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  37.28 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  35.48 
 
 		 605 aa  331  3e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  37.08 
 
 		 578 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  35.73 
 
 		 574 aa  329  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  35.93 
 
 		 560 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  36.9 
 
 		 578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  36.43 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  37.33 
 
 		 564 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  35.54 
 
 		 578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  36.03 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  35 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  35.24 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  37.06 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.38 
 
 		 549 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 579 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  35.66 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  36.42 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  35.65 
 
 		 539 aa  321  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 		 570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 		 570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  37.33 
 
 		 547 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 		 570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 550 aa  320  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 540 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 		 549 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.68 
 
 		 579 aa  319  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 574 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  36.48 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>