More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1196 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 515 aa  1048    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  53.77 
 
 		 510 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  52.4 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  50.69 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  46.46 
 
 		 499 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 517 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 517 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 517 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 		 517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  40.51 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 519 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  37.96 
 
 		 514 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 521 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 521 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  35.93 
 
 		 528 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 518 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  34.51 
 
 		 521 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  35.49 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  36.6 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  34.9 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  34.33 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 515 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 516 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 516 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 546 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 518 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 517 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  34.83 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  33.74 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  34.64 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.1 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  34.64 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 547 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 517 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 525 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 		 525 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 520 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 519 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.75 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 526 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 517 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 526 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  33.66 
 
 		 559 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 525 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.52 
 
 		 503 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 516 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 		 524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  32.54 
 
 		 571 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 521 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 524 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 512 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 525 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  30.43 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 500 aa  243  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.55 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 534 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 528 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 528 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.71 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 528 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>