More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3976 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  73.08 
 
 		 532 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  72.98 
 
 		 571 aa  787    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  73.46 
 
 		 532 aa  780    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  71.17 
 
 		 547 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 546 aa  1104    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  73.27 
 
 		 532 aa  778    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  73.42 
 
 		 559 aa  812    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  73.27 
 
 		 532 aa  778    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 528 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  44.42 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  45.23 
 
 		 521 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  44.24 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 521 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  44.11 
 
 		 523 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  43.1 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 529 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  43.52 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  42.8 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  44.29 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 512 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  36.48 
 
 		 514 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  44.02 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  44.59 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 534 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 715 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 519 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 519 aa  276  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  41.34 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 515 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 520 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.09 
 
 		 565 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 519 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 515 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 516 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 524 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 518 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 518 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 509 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 517 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 534 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 517 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 499 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 		 525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 517 aa  243  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 498 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 520 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 		 525 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.98 
 
 		 525 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 		 526 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 516 aa  236  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  30.94 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.65 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33 
 
 		 503 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  31.71 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 525 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 523 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.36 
 
 		 530 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 508 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 530 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 524 aa  230  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 551 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 511 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.81 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  32.17 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.27 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>