More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2862 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 528 aa  1071    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  51.72 
 
 		 559 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  51.24 
 
 		 546 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  51.42 
 
 		 571 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  51.93 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  51.93 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  51.74 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  51.35 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  50.86 
 
 		 547 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  47.84 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  46.76 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  46.35 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  46.64 
 
 		 521 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  45.26 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  45.24 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  47 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  45.82 
 
 		 523 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  44.29 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  42.64 
 
 		 531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  44.29 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  40.2 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 518 aa  336  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 517 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 517 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 521 aa  307  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 		 517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 534 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 517 aa  301  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 519 aa  301  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 489 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 517 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 515 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 515 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 534 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 517 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.54 
 
 		 503 aa  276  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 512 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 715 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  34.7 
 
 		 532 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 533 aa  269  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.02 
 
 		 565 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 519 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 		 545 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 515 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  31.64 
 
 		 549 aa  262  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  33.98 
 
 		 545 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 508 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 523 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 556 aa  259  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.8 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  36.17 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 532 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 492 aa  256  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.62 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 526 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1782  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 493 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0876128  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 508 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 518 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 518 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 502 aa  249  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 508 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  33.85 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  35.11 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>