More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2729 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  72.78 
 
 		 532 aa  784    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  71.61 
 
 		 547 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  73.69 
 
 		 571 aa  794    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  72.59 
 
 		 532 aa  784    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  72.96 
 
 		 532 aa  785    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  73.42 
 
 		 546 aa  800    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 559 aa  1142    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  72.96 
 
 		 532 aa  785    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  51.72 
 
 		 528 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  42.75 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  42.78 
 
 		 521 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  42.96 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  42.44 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  42.03 
 
 		 521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  40.11 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  42.39 
 
 		 521 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  42.17 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  41.52 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  41.07 
 
 		 520 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 517 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  42.19 
 
 		 517 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  42.9 
 
 		 517 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 521 aa  289  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  42.9 
 
 		 517 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  43.41 
 
 		 514 aa  289  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 512 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  41.36 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  44.02 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 516 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 		 534 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 715 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 526 aa  263  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 516 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 534 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 519 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 517 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 518 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 509 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 515 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.73 
 
 		 565 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 504 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 517 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 523 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 515 aa  249  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 520 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 518 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 499 aa  240  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 520 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 525 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.47 
 
 		 519 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 532 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 515 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 		 525 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 518 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.4 
 
 		 530 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.15 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.51 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 551 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  30.52 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.23 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 525 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 508 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 494 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 1043 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 510 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>