More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1837 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  72.2 
 
 		 517 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  70.13 
 
 		 519 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  71.24 
 
 		 517 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  71.62 
 
 		 517 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  71.62 
 
 		 517 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 518 aa  1070    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  54.14 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  46.29 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  45.75 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 521 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 		 504 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  37.79 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.16 
 
 		 525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  39.2 
 
 		 528 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 		 515 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.96 
 
 		 526 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 498 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 511 aa  333  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  40.51 
 
 		 515 aa  331  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 		 509 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 534 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 515 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.31 
 
 		 519 aa  325  9e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 515 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  37.4 
 
 		 521 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.65 
 
 		 565 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 		 510 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.66 
 
 		 526 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.56 
 
 		 525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 523 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  38.83 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  36.68 
 
 		 523 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 517 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.77 
 
 		 525 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  40.92 
 
 		 521 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 530 aa  315  9e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  39.48 
 
 		 521 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 		 527 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  37.64 
 
 		 521 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.61 
 
 		 525 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 526 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 516 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 518 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 534 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 520 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 518 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 518 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 524 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 519 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  35.24 
 
 		 559 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  37.13 
 
 		 522 aa  289  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 504 aa  289  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  37.65 
 
 		 502 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 518 aa  287  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  32.32 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  36.81 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  43.25 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  33.93 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 551 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 519 aa  280  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 521 aa  279  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 520 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 517 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 529 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 502 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 518 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 494 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 494 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>