More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2871 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 521 aa  1074    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 518 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 519 aa  363  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 517 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 517 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 517 aa  360  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 519 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  35.84 
 
 		 514 aa  320  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 		 521 aa  316  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 534 aa  289  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  36.53 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  33.01 
 
 		 531 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 518 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  35.87 
 
 		 523 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 		 559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  43.58 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  34.7 
 
 		 521 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 		 521 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  32.82 
 
 		 521 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  32.69 
 
 		 521 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 523 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  41.71 
 
 		 520 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  35.08 
 
 		 521 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 518 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  41.34 
 
 		 546 aa  263  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  41.96 
 
 		 502 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.53 
 
 		 565 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 519 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 532 aa  256  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  42.33 
 
 		 547 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 512 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  42.33 
 
 		 532 aa  253  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 516 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  42.64 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 520 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 519 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  43.08 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  42.33 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  42.33 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 518 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  38.8 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.98 
 
 		 526 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 504 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.35 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 515 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  32.34 
 
 		 520 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 518 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 525 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.39 
 
 		 525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 526 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.09 
 
 		 526 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 1043 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.41 
 
 		 527 aa  230  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 521 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  31.4 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 525 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 499 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 518 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 662 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 715 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.27 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 520 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  31.77 
 
 		 536 aa  220  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 540 aa  220  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 528 aa  220  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.12 
 
 		 516 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>