More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0739 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  95.11 
 
 		 532 aa  994    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  73.27 
 
 		 546 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 532 aa  1085    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  83.14 
 
 		 571 aa  900    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  99.81 
 
 		 532 aa  1083    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  93.23 
 
 		 547 aa  965    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 532 aa  1085    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  72.96 
 
 		 559 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  51.93 
 
 		 528 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  44.65 
 
 		 521 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  44.47 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  44.66 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  43.68 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  43.68 
 
 		 523 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  41.24 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  41.92 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  41.98 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 		 521 aa  309  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  36.96 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 517 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 517 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 517 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  42.35 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 515 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.78 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 519 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  41.89 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 715 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 518 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 518 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 518 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 517 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 515 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 502 aa  262  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  41.48 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 515 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 509 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 515 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 505 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 518 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 532 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 551 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 536 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 494 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  30.74 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 517 aa  248  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 494 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 494 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 508 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 515 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 515 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 		 519 aa  246  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.48 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 508 aa  243  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.03 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 517 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.4 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 516 aa  237  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>