More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1730 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 516 aa  1041    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  43.89 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 517 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  41.75 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  42.89 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  42.52 
 
 		 521 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 519 aa  360  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 521 aa  334  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 515 aa  319  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  39.34 
 
 		 521 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.78 
 
 		 565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  38.73 
 
 		 521 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 504 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.39 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 521 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  36.74 
 
 		 502 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 498 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  35.69 
 
 		 523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 516 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 523 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  35.94 
 
 		 521 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  36.73 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  35.93 
 
 		 559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  36.87 
 
 		 520 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 534 aa  273  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  35.54 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  36.14 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  35.96 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  35.96 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 534 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 532 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 521 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.03 
 
 		 519 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  35.7 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  35.15 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 518 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 517 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  35.77 
 
 		 532 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 520 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.08 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.78 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  34.25 
 
 		 542 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 511 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 526 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 546 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 		 549 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 502 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 509 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  33.07 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.44 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  33.07 
 
 		 536 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 525 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 518 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  33.92 
 
 		 545 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 525 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 534 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 518 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 524 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>