More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0798 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  69.57 
 
 		 510 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  77.14 
 
 		 504 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 499 aa  1007    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  50.69 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  48.5 
 
 		 498 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  48.81 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 518 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 517 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 516 aa  310  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 517 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 517 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 519 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  35.98 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  36.03 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  35.4 
 
 		 521 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  36.16 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.34 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 516 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 515 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 517 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 499 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 518 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 512 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  32.37 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  33.47 
 
 		 502 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  34.81 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  38.27 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  38.27 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 520 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  38.27 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  37.95 
 
 		 559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 487 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 546 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  37.82 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  33.53 
 
 		 522 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 519 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 521 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 494 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 519 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 532 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 		 526 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  32.32 
 
 		 528 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  34.91 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 520 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 518 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 519 aa  226  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 518 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 514 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 		 526 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  32.07 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  33.67 
 
 		 504 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  31.26 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1782  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0876128  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 508 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 521 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.73 
 
 		 527 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 522 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 		 510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 		 525 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 525 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 		 530 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 587 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>