More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1782 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  84.35 
 
 		 489 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1782  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 493 aa  1003    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0876128  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  81.5 
 
 		 494 aa  829    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  81.5 
 
 		 494 aa  828    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  81.5 
 
 		 494 aa  829    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  52.18 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  50.4 
 
 		 504 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  49.23 
 
 		 524 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  50.59 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0632  AMP-dependent synthetase and ligase  48.3 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  46.71 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  47.42 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  49.89 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  49.46 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3955  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 		 508 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132635  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  46.93 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  46.34 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  44.95 
 
 		 551 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  38.68 
 
 		 536 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  38.12 
 
 		 529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  37.67 
 
 		 532 aa  299  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  37.14 
 
 		 533 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  37.5 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  36.05 
 
 		 545 aa  289  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  37.16 
 
 		 531 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  36.54 
 
 		 545 aa  277  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  35.5 
 
 		 549 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  35.33 
 
 		 542 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 528 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 515 aa  259  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 530 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 525 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.37 
 
 		 565 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 		 526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  36.06 
 
 		 521 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.9 
 
 		 519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 512 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 521 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 519 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  34.5 
 
 		 514 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 516 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 531 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 512 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 520 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 525 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 526 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 511 aa  236  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 517 aa  236  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 		 525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  35.74 
 
 		 513 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 504 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 511 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.38 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.28 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.59 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.89 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 505 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  37.81 
 
 		 531 aa  230  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  31.01 
 
 		 496 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 519 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 521 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  34.31 
 
 		 503 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  33.92 
 
 		 508 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 521 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  31.01 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 1043 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  31.01 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.74 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 520 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8226  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 515 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 501 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 502 aa  226  9e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  34.24 
 
 		 536 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  30.82 
 
 		 496 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>