More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4181 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 527 aa  1074    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.99 
 
 		 556 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.99 
 
 		 556 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.99 
 
 		 556 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.75 
 
 		 579 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.9 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  56.01 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  56.31 
 
 		 534 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.15 
 
 		 554 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  52.23 
 
 		 525 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  50.39 
 
 		 526 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  47.23 
 
 		 1043 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  45.23 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 516 aa  346  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 		 532 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 509 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 514 aa  316  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.88 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.88 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.88 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.21 
 
 		 525 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.33 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 540 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 		 525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 502 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.84 
 
 		 503 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 509 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 520 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 508 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 518 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 508 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.14 
 
 		 526 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  36.13 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 519 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 520 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.96 
 
 		 520 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 518 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 584 aa  291  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 		 530 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.13 
 
 		 524 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 508 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.69 
 
 		 529 aa  289  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.04 
 
 		 516 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.01 
 
 		 527 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.51 
 
 		 526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 524 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.09 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 505 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  35.85 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  36.56 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  35.02 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.86 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 496 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.15 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 509 aa  279  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  31.37 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 511 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.65 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 537 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 537 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 		 522 aa  277  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 537 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  37.06 
 
 		 556 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.28 
 
 		 525 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 608 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 517 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 539 aa  273  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 507 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  34.88 
 
 		 516 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 511 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.94 
 
 		 518 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>