More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0861 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 514 aa  1041    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 521 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 527 aa  299  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 512 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 		 526 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 1043 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 511 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 516 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 		 527 aa  280  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 509 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.83 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 525 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.17 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 502 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 525 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 		 514 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 523 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 508 aa  276  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 518 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 513 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 520 aa  273  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 508 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.75 
 
 		 518 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4229  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.78 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.25 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 		 526 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 511 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 525 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 508 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 556 aa  264  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 508 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 505 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.94 
 
 		 500 aa  263  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.63 
 
 		 515 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 519 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  38.22 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 546 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 501 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 519 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 		 525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 521 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 506 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 543 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.91 
 
 		 525 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 		 509 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.55 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 511 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  34.75 
 
 		 545 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 518 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 511 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 		 514 aa  256  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 531 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 561 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 500 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 583 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>