More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2927 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.03 
 
 
514 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  78.06 
 
 
543 aa  834    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.89 
 
 
524 aa  812    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
509 aa  1040    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.44 
 
 
516 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.17 
 
 
509 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.1 
 
 
509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  48.24 
 
 
508 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  48.02 
 
 
510 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.9 
 
 
500 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.13 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.22 
 
 
497 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.22 
 
 
497 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.76 
 
 
501 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.64 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  40.95 
 
 
515 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.09 
 
 
512 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.3 
 
 
514 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.2 
 
 
522 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.68 
 
 
514 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  38.57 
 
 
544 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.6 
 
 
513 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 
516 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
516 aa  341  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  40.12 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  39.55 
 
 
492 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 
516 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  41.55 
 
 
525 aa  340  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.8 
 
 
518 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.41 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.63 
 
 
516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.25 
 
 
515 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 
515 aa  333  5e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.28 
 
 
516 aa  333  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 
516 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  37.97 
 
 
527 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  38.98 
 
 
515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  38.98 
 
 
515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.16 
 
 
512 aa  329  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.1 
 
 
512 aa  329  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  38.78 
 
 
515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.17 
 
 
537 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
509 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 
521 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
512 aa  323  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 
546 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
519 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  39.68 
 
 
511 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
524 aa  316  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  37.05 
 
 
514 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
510 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
522 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 
516 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  38.55 
 
 
520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 
517 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  37.52 
 
 
516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  38.25 
 
 
516 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.66 
 
 
522 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  38.59 
 
 
501 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  38.59 
 
 
501 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  38.59 
 
 
501 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
518 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 
525 aa  286  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.95 
 
 
536 aa  283  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
523 aa  276  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
511 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
521 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.15 
 
 
530 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
520 aa  263  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
508 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 
512 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 
526 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
497 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
520 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
514 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 
519 aa  257  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
523 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.68 
 
 
527 aa  256  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
499 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 
492 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 
525 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
517 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
517 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 
532 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
509 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 
517 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
525 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
524 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
520 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
493 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  35.38 
 
 
504 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
518 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>