More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4042 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  61.15 
 
 		 591 aa  720    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 582 aa  1177    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  62.32 
 
 		 602 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  61.85 
 
 		 570 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  75.92 
 
 		 601 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  55.87 
 
 		 584 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  59.52 
 
 		 590 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  55.85 
 
 		 587 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  51.33 
 
 		 551 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  51.61 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  47.14 
 
 		 583 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  39.65 
 
 		 570 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.3 
 
 		 644 aa  361  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 569 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 512 aa  332  9e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 521 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 565 aa  321  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  40.45 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 555 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 557 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 501 aa  297  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 566 aa  296  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 539 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 		 521 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 		 506 aa  290  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.63 
 
 		 552 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 		 561 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 		 561 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 518 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 523 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 523 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 		 563 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 		 563 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.7 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 523 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 519 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 576 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 		 513 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 553 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 570 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 525 aa  283  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 516 aa  283  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 523 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  35.11 
 
 		 576 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 582 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 		 514 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.09 
 
 		 561 aa  280  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  34.1 
 
 		 549 aa  279  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 563 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  35.51 
 
 		 570 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  35.51 
 
 		 570 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 559 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  35.51 
 
 		 570 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  35.85 
 
 		 570 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 508 aa  276  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 506 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.37 
 
 		 529 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  35.53 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 511 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 590 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 509 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 549 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 499 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 549 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 569 aa  273  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 526 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 511 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 525 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.77 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  34.16 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  34.3 
 
 		 544 aa  272  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.7 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>