More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3492 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 555 aa  1120    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 551 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 584 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  35.83 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 526 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 582 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 583 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 536 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 591 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 602 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 570 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 499 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 521 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.61 
 
 		 546 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 518 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 518 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 566 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.9 
 
 		 644 aa  236  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 537 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.44 
 
 		 531 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 513 aa  233  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  34.5 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  34.43 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 516 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  37.18 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 526 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 566 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 564 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 526 aa  230  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 561 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 525 aa  230  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 561 aa  230  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 542 aa  230  6e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 		 582 aa  230  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 		 506 aa  229  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 569 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 561 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  31.77 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.51 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.51 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.06 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  33.72 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 843 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 499 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 		 563 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 557 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.87 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 540 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 540 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 526 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  32.75 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  30.32 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 552 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  33.67 
 
 		 557 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 557 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  32.46 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.24 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  36.34 
 
 		 501 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  34.66 
 
 		 506 aa  224  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>