More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2153 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  56.45 
 
 
570 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  61.15 
 
 
582 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
591 aa  1215    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  55.38 
 
 
584 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  59.3 
 
 
601 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  59.97 
 
 
587 aa  701    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  56.65 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  52.52 
 
 
590 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  50.18 
 
 
551 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  49.29 
 
 
553 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 
583 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 
574 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
571 aa  362  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.41 
 
 
644 aa  361  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
569 aa  340  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
565 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
512 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 
521 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 
569 aa  298  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
578 aa  297  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
508 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
508 aa  290  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 
508 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
539 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 
499 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 
566 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
508 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.22 
 
 
561 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 
557 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.03 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 
582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 
582 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.92 
 
 
515 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
525 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
559 aa  280  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
555 aa  280  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  35.85 
 
 
496 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  35.85 
 
 
496 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 
496 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 
518 aa  277  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
501 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 
549 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.81 
 
 
500 aa  274  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.07 
 
 
561 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
590 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 
520 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.85 
 
 
516 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 
514 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
527 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 
544 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
525 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
770 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
510 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
591 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 
496 aa  266  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
490 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
551 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
549 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
523 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
523 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.08 
 
 
514 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
561 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
544 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
553 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 
549 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 
510 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 
549 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
565 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
511 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 
523 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
577 aa  260  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.5 
 
 
518 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.86 
 
 
544 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
506 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
511 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
561 aa  259  9e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 
510 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.18 
 
 
510 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
527 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
519 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
523 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
510 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
510 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
518 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
516 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 
574 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
527 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.02 
 
 
503 aa  258  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
510 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 
549 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>