More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3598 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 578 aa  1161    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 551 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 553 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  37.89 
 
 		 601 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 584 aa  326  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 582 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 574 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 569 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 590 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 591 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 571 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 518 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 506 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.89 
 
 		 529 aa  247  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.54 
 
 		 516 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  34.34 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  35.38 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 525 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 		 662 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  34.31 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.48 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 525 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 569 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 555 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 496 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 496 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 		 525 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.7 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 525 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 512 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  34.91 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  33.07 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  32.14 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.04 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 521 aa  234  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  33.82 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 551 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.49 
 
 		 496 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.01 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 565 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.45 
 
 		 644 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.96 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 487 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 513 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  32.71 
 
 		 517 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 512 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 525 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 504 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 515 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.93 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  36.98 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  35.33 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 527 aa  229  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 		 570 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.07 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.36 
 
 		 514 aa  227  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  36.78 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.09 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.09 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.09 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.15 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.23 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  34.2 
 
 		 505 aa  225  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.19 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>