More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0681 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 570 aa  1166    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  59.62 
 
 		 569 aa  690    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  42.41 
 
 		 571 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 582 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 584 aa  356  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  37.69 
 
 		 601 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 591 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 590 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 602 aa  293  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 574 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 565 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 555 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.69 
 
 		 644 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 521 aa  240  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  32 
 
 		 570 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 512 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 570 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 		 576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 576 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 502 aa  233  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  30.34 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.27 
 
 		 578 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  32.68 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 567 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 526 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  30.53 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 536 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  28.87 
 
 		 584 aa  223  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  28.92 
 
 		 602 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  31.38 
 
 		 575 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.39 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  30.32 
 
 		 571 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  31 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 508 aa  220  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 559 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.37 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  30.51 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.14 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  29.06 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  30.89 
 
 		 575 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  31.52 
 
 		 571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 566 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  30.65 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 		 566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 527 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  30.45 
 
 		 562 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  32.3 
 
 		 500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 510 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 520 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 560 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 522 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.34 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 578 aa  213  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  29.81 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 640 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.41 
 
 		 519 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 578 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  30.16 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  30.61 
 
 		 562 aa  210  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.14 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 539 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 569 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.38 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 572 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 550 aa  209  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  31.59 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>