More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3960 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 523 aa  1038    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  99.04 
 
 		 523 aa  1026    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  99.04 
 
 		 523 aa  1026    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 536 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 526 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 529 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 584 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  35.47 
 
 		 601 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 551 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 591 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 587 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 602 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 570 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 569 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 590 aa  216  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.32 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  30 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 574 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 510 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.26 
 
 		 644 aa  206  9e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.32 
 
 		 544 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 549 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.68 
 
 		 529 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.92 
 
 		 549 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.5 
 
 		 549 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.54 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  29.3 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 518 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 552 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.27 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 544 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 1043 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.91 
 
 		 828 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 554 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 		 514 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 511 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 515 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 565 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.85 
 
 		 576 aa  196  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 518 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  29.87 
 
 		 576 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 538 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.75 
 
 		 481 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  30.88 
 
 		 572 aa  194  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 563 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 520 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.32 
 
 		 549 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 843 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.96 
 
 		 481 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 527 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 576 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 571 aa  192  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.25 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 570 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 577 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.69 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.17 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  26.82 
 
 		 549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.74 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  30.55 
 
 		 564 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.49 
 
 		 538 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 502 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 548 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>